RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAMP3O60896 148 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 FCGR3BO75015 233 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 MSMBP08118 114 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRTN3P24158 256 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL3RAP26951 378 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF585BQ52M93 769 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM186Q96B77 213 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf159Q96HA4 380 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10C1Q96KK4 312 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.04□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOX4O94842 621 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 REG1BP48304 166 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 THBS3P49746 956 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLRD1Q13241 179 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL22RA2Q969J5 263 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.03□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARG1P05089 322 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPA2P15927 270 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASB13Q8WXK3 278 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 C2orf50Q96LR7 162 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 COMMD9Q9P000 198 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.02□□□□□ -0.16
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.02□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGLV1-47P01700 117 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKR1C2P52895 323 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIRPDQ9H106 197 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAHCC1Q9P281 2608 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PRD5 423 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PRF3 423 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1W2PRM7 423 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 S1PR2O95136 353 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGKV1-39P01597 117 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1QBP02746 253 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGKV1D-39P04432 117 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CT45A6P0DMU7 189 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CT45A5P0DMU8 189 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CT45A7P0DMV0 189 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 VDAC1P21796 283 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIR2DS2P43631 304 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF383Q8NA42 475 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 NMES1Q9C002 83 aa14.01□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOTCH2Q04721 2471 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS13CQ709C8 3753 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CREBBPQ92793 2442 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 GZMKP49863 264 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q5BKY6 102 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOXA1Q86UR1 476 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR11H6Q8NGC7 330 aa14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CR1P17927 2039 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATG12O94817 140 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRASP01116 189 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPHA1P21709 976 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 GATA3P23771 443 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM71F2Q6NXP2 309 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4P4Q8NGL7 312 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDB2Q92466 427 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 HIF1ANQ9NWT6 349 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP13.99□□□□□ -0.17
USP3-AS1-201ENST00000558831 HPRT1P00492 218 aa13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.7 ms