RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 TRAM1Q15629 374 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ECSCRQ19T08 205 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 DEFB136Q30KP8 78 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 IGSF11Q5DX21 431 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR52W1Q6IF63 320 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ASCL4Q6XD76 172 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZTK2 550 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00596Q86U02 117 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LYPD6Q86Y78 171 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM86BQ8N661 226 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR2AK2Q8NG84 335 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PHYHIPQ92561 330 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 THRSPQ92748 146 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR5B12Q96R08 314 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CLCC1Q96S66 551 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR2D2Q9H210 308 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PARP11Q9NR21 331 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 DPM3Q9P2X0 92 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SSR3Q9UNL2 185 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.39□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NOTCH1P46531 2555 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 IFITM5A6NNB3 132 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SERPINE3A8MV23 424 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 M0R1X1 148 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KCNAB3O43448 404 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 AIREO43918 545 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TNFAIP8O95379 198 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FCGR3AP08637 254 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HOXB5P09067 269 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 UBBP0CG47 229 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SMIM18P0DKX4 95 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CGB3P0DN86 165 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CGB7P0DN87 165 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 IL3RAP26951 378 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CD34P28906 385 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 BRS3P32247 399 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KCNJ3P48549 501 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 COMPP49747 757 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ARHGDIBP52566 201 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GNG2P59768 71 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 VBP1P61758 197 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GNB1P62873 340 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HERPUD1Q15011 391 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PLGLAQ15195 96 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MMDQ15546 238 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HMGN3Q15651 99 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RNLSQ5VYX0 342 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C5orf56Q8N8D9 126 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FCGR1BQ92637 280 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CORO2AQ92828 525 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RAB3CQ96E17 227 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MALSU1Q96EH3 234 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CITED1Q99966 193 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TM2D1Q9BX74 207 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GHITMQ9H3K2 345 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RHOFQ9HBH0 211 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms