RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555015.5

SRP54-AS1-202, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 561 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF383Q8NA42 475 aa10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.25□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HERV-K104P61576 105 aa10.24□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 KLK11Q9UBX7 282 aa10.24□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NPBQ8NG41 125 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SECTM1Q8WVN6 248 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 DDB2Q92466 427 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BORCS5Q969J3 196 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 MOB3AQ96BX8 217 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RITA1Q96K30 269 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KIAA1456Q9P272 454 aa10.23□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 PEX14O75381 377 aa10.22□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAS2R19P59542 299 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FXYD4P59646 89 aa10.22□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM17Q86X19 198 aa10.22□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM229BQ8NBD8 167 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 WNT10AQ9GZT5 417 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 SLC5A7Q9GZV3 580 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 V9GYH0 126 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa10.22□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 KCNAB3O43448 404 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 HLA-DRB1P01911 266 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD74P04233 296 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CD3DP04234 171 aa10.21□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
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SRP54-AS1-202ENST00000555015 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TMEM177Q53S58 311 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCDC190Q86UF4 302 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 ARRDC1Q8N5I2 433 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 BVESQ8NE79 360 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CITED1Q99966 193 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 CCL28Q9NRJ3 127 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 TAS2R8Q9NYW2 309 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa10.21□□□□□ -0.77
SRP54-AS1-202ENST00000555015 VWFP04275 2813 aa10.21□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 A6NHS1 94 aa10.2□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 M0QYG6 137 aa10.2□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 RRHO14718 337 aa10.2□□□□□ -0.78
SRP54-AS1-202ENST00000555015 PLXNB1O43157 2135 aa10.2□□□□□ -0.78
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