RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	TOMM40L	Q969M1	308 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RPE	Q96AT9	228 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	DUX3	Q96PT4	197 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	KLK11	Q9UBX7	282 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	TCF19	Q9Y242	345 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222		V9GYH0	126 aa		10.92	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	HSD17B6	O14756	317 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ST8SIA5	O15466	376 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	LANCL1	O43813	399 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	LYL1	P12980	280 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ETV6	P41212	452 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	TAS2R46	P59540	309 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	DGCR2	P98153	550 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	CDK10	Q15131	360 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	HERC2	O95714	4834 aa		10.91	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPI3	338 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RAB29	O14966	203 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RBBP9	O75884	186 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	TUSC2	O75896	110 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR5H8	P0DN80	308 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	HLA-DMA	P28067	261 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	REG1B	P48304	166 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	RFX2	P48378	723 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ACTB	P60709	375 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.9	□□□□□ -0.66
CS-231	ENST00000552222	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TXNL1	O43396	289 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	HRH1	P35367	487 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR3A3	P47888	321 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF79	Q15937	498 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	PALMD	Q9NP74	551 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	PROP1	O75360	226 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	PMP2	P02689	132 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CD24	P25063	80 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	FCGR2C	P31995	323 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	BRS3	P32247	399 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	GPR12	P47775	334 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR56B4	Q8NH76	319 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	DPF1	Q92782	380 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RCHY1	Q96PM5	261 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	S1PR3	Q99500	378 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	EHF	Q9NZC4	300 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.88	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	PPY	P01298	95 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CD3D	P04234	171 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		10.87	□□□□□ -0.67

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