RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 FOXA1P55317 472 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PSMG4Q5JS54 123 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR1F12Q8NHA8 337 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 COL4A1P02462 1669 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 SEC11BP0C7V7 166 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 PSMB2P49721 201 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 NTNG1Q9Y2I2 539 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-210ENST00000551525 TPRP12270 2363 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FUT6P51993 359 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 COL10A1Q03692 680 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR51H1Q8NH63 302 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GTH9 108 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PNR3 127 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS37A4D1T9 235 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 DPM2O94777 84 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GZMHP20718 246 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf195Q5TG92 126 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PP6455Q8WZ26 134 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 NMES1Q9C002 83 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SBF1O95248 1867 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ODAMA1E959 279 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR2T8A6NH00 312 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR5AL1P0C617 328 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CD59P13987 128 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TBR1Q16650 682 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LYG1Q8N1E2 194 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TAAR3PQ9P1P4 343 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RABAC1Q9UI14 185 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 NEU3Q9UQ49 428 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM250H0YL14 139 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS23O95084 383 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SOD1P00441 154 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 DEFA4P12838 97 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MMP9P14780 707 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RTP5Q14D33 572 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SPINK14Q6IE38 97 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 HMGN2P46Q86SG4 172 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RDH5Q92781 318 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MANBALQ9NQG1 85 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PSG8Q9UQ74 426 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC7Q9Y286 467 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 Q499Y3 187 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PAGE3Q5JUK9 113 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 DUX3Q96PT4 197 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ERG28Q9UKR5 140 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JLM5 398 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MMP23AO75900 390 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 IL4P05112 153 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CELA3AP09093 270 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GNLYP22749 145 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DS2P43631 304 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 K7ENP7 123 aa5.45□□□□□ -1.54
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