RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551098.5

DDX23-208, Transcript of DEAD-box helicase 23, human

TSL 2

Gene DDX23, Length 1,083 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX23-208	ENST00000551098	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	RAMP3	O60896	148 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	OR8U8	P0C7N1	319 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	NDP	Q00604	133 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF616	Q08AN1	781 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	CBX3	Q13185	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098		I3L521	148 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	SPDEF	O95238	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	DIRAS3	O95661	229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	CA2	P00918	260 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	RUNX1	Q01196	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	FHL3	Q13643	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.53	□□□□□ -0.24
DDX23-208	ENST00000551098	SLC25A17	O43808	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	CNIH1	O95406	144 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	LGALS7	P47929	136 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SOX15	O60248	233 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SCGN	O76038	276 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	DTYMK	P23919	212 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ECI1	P42126	302 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	GNB1	P62873	340 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	CD69	Q07108	199 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	FXYD3	Q14802	87 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SHOX	O15266	292 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	RRAS	P10301	218 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SDC2	P34741	201 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	PITPNA	Q00169	270 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	MXD1	Q05195	221 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098		Q6ZS49	121 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	BVES	Q8NE79	360 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	HARBI1	Q96MB7	349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.5	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098		J3QRK9	145 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	TPPP2	P59282	170 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	GNG2	P59768	71 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	NEDD8	Q15843	81 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.49	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	LINC01619	G3V211	115 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	OVOL1	O14753	267 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	TRGV3	P03979	118 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	INSL3	P51460	131 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	DCUN1D4	Q92564	292 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	PRR25	Q96S07	402 aa		13.48	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.47	□□□□□ -0.25
DDX23-208	ENST00000551098	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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