RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN9O75954 239 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 UCP3P55916 312 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FXYD4P59646 89 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF5Q99942 180 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 CCL28Q9NRJ3 127 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 WASHC3Q9Y3C0 194 aa13.14□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM89A2RUT3 159 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RNF212BA8MTL3 300 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FGF16O43320 207 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 APOA2P02652 100 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 GNRHRP30968 328 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00205P59089 165 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 AP3S2P59780 193 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RELBQ01201 579 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 HNF4GQ14541 408 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 LHFPL1Q86WI0 220 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 PDPNQ86YL7 162 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 MFSD4AQ8N468 514 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4D10Q8NGI6 311 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 DDB2Q92466 427 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FXYD6Q9H0Q3 95 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 AKIP1Q9NQ31 210 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.13□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 DISC1C4P0D8 188 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF735P0CB33 412 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RRASP10301 218 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 Q6ZSV7 163 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 TOMM5Q8N4H5 51 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 BVESQ8NE79 360 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 TERB2Q8NHR7 220 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 S100ZQ8WXG8 99 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 C16orf95Q9H693 158 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 PLSCR3Q9NRY6 295 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.12□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00473A8K010 186 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 H7C2Y5 167 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 AMY2AP04746 511 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RAG2P55895 527 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FOXL1Q12952 345 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RTL8BQ17RB0 113 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 NPBQ8NG41 125 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4C16Q8NGL9 310 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 OR4F5Q8NH21 305 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 PRSS22Q9GZN4 317 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa13.11□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1B0GUS0 222 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR31O00270 319 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 AMY1AP04745 511 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FAUP35544 74 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 ECI1P42126 302 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 COMPP49747 757 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 BLCAPP62952 87 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 CBX3Q13185 183 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 BAK1Q16611 211 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 C11orf88Q6PI97 169 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 KCTD9Q7L273 389 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC38A6Q8IZM9 456 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8N2B8 174 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8N9W7 124 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RITA1Q96K30 269 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 PRRT1Q99946 306 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RSRP1Q9BUV0 290 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC2A8Q9NY64 477 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 MMP24Q9Y5R2 645 aa13.1□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 NDUFA3O95167 84 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 IGKV1-16P04430 117 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 KIR2DS2P43631 304 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 F2RL1P55085 397 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 MMDQ15546 238 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM177Q53S58 311 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIQKQ629K1 86 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 FAAP20Q6NZ36 180 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 MDFIQ99750 246 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF702PQ9H963 129 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 BEX1Q9HBH7 125 aa13.09□□□□□ -0.31
PACSIN3-210ENST00000533686 HRASLSQ9HDD0 168 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms