RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521865.5

PABPC1-218, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2

Gene PABPC1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-218ENST00000521865 PROP1O75360 226 aa16■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 HSMCR30P0CW71 290 aa16■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 RAB11BQ15907 218 aa16■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 FAM89BQ8N5H3 189 aa16■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 PECRQ9BY49 303 aa15.99■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 H3BUA1 57 aa15.98■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 ARL6IP5O75915 188 aa15.98■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 CD37P11049 281 aa15.98■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 CLDN12P56749 244 aa15.98■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.98■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 OR56B1Q8NGI3 324 aa15.98■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 SERPINB10P48595 397 aa15.97■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 CBX3Q13185 183 aa15.97■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 HARBI1Q96MB7 349 aa15.97■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.97■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 PHB2Q99623 299 aa15.96■□□□□ 0.15
PABPC1-218ENST00000521865 OR2D2Q9H210 308 aa15.96■□□□□ 0.15
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PABPC1-218ENST00000521865 OR10J5Q8NHC4 309 aa15.94■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 CCDC90BQ9GZT6 254 aa15.94■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 C19orf73Q9NVV2 129 aa15.94■□□□□ 0.14
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PABPC1-218ENST00000521865 IGSF11Q5DX21 431 aa15.93■□□□□ 0.14
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PABPC1-218ENST00000521865 RAB3CQ96E17 227 aa15.93■□□□□ 0.14
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PABPC1-218ENST00000521865 TUBA4BQ9H853 241 aa15.93■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 V9GY05 133 aa15.93■□□□□ 0.14
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PABPC1-218ENST00000521865 TENM2Q9NT68 2774 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 A8MZ25 164 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 GSTT2P0CG29 244 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 GSTT2BP0CG30 244 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 RPEL1Q2QD12 228 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 SPATA25Q9BR10 227 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 GINS4Q9BRT9 223 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 RAB22AQ9UL26 194 aa15.92■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 SACSQ9NZJ4 4579 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 A0A075B6Q4 140 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 LCE6AA0A183 80 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 MPPED1O15442 326 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 RGS10O43665 173 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 CRYGBP07316 175 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 FCGR3AP08637 254 aa15.91■□□□□ 0.14
PABPC1-218ENST00000521865 PSMD7P51665 324 aa15.91■□□□□ 0.14
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