RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF383Q8NA42 475 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PALMDQ9NP74 551 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TENM3Q9P273 2699 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 H3BUA1 57 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV1-16P04430 117 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CD3GP09693 182 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM50BP56557 158 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM3DQ96BQ1 224 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM68Q96MH6 324 aa14.83□□□□□ -0.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 PROP1O75360 226 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TPBGQ13641 420 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TATDN3Q17R31 274 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 POC5Q8NA72 575 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB22AQ9UL26 194 aa14.82□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 V9GY05 133 aa14.82□□□□□ -0.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 LYL1P12980 280 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CLDN12P56749 244 aa14.81□□□□□ -0.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 IRF3Q14653 427 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 CASC10Q5T4H9 136 aa14.81□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 BET1O15155 118 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 LDLRAD4O15165 306 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 FABP7O15540 132 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 GADD45AP24522 165 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 RTL8BQ17RB0 113 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB3CQ96E17 227 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 PHB2Q99623 299 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 GFI1Q99684 422 aa14.8□□□□□ -0.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 TALDO1P37837 337 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 HES5Q5TA89 166 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 MGLLQ99685 303 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 GINS4Q9BRT9 223 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 DUSP21Q9H596 190 aa14.78□□□□□ -0.04
SH3BP2-220ENST00000511663 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP2-220ENST00000511663 GSTT2BP0CG30 244 aa14.77□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.77□□□□□ -0.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.76□□□□□ -0.05
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SH3BP2-220ENST00000511663 CITED4Q96RK1 184 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A075B6Q4 140 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 BRI3O95415 125 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 DIRAS3O95661 229 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 CRYGBP07316 175 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 FCGR3AP08637 254 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 AQP4P55087 323 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNJ2BPP57105 145 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ARFRP1Q13795 201 aa14.75□□□□□ -0.05
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