RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 OR5H14A6NHG9 310 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 DISC1C4P0D8 188 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2F2O95006 317 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 AKAIN1P0CW23 69 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-204ENST00000503638 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 RAG2P55895 527 aa10.72□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 KCTD9Q7L273 389 aa10.72□□□□□ -0.69
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PGGT1B-204ENST00000503638 SHOXO15266 292 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 NBR2O15453 112 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 CRYZL1O95825 349 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1-16P04430 117 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 RRASP10301 218 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 BLCAPP62952 87 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 RELBQ01201 579 aa10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXL1Q12952 345 aa10.68□□□□□ -0.7
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