RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489549.5

GABPB2-206, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, human

TSL 3

Gene GABPB2, Length 915 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABPB2-206	ENST00000489549	CMTM3	Q96MX0	182 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549		H7C2Y5	167 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	SLC22A5	O76082	557 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	GABARAP	O95166	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	LGALS7	P47929	136 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	THBS3	P49746	956 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	LINC00205	P59089	165 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	TMEM177	Q53S58	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	PF4	P02776	101 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	CRYGB	P07316	175 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	RRAS	P10301	218 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	MYCNOS	P40205	109 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	CBX5	P45973	191 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	NCS1	P62166	190 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	CX3CL1	P78423	397 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	NDP	Q00604	133 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	MSMO1	Q15800	293 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	P2RX4	Q99571	388 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	FCN1	O00602	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ALDH3B2	P48448	385 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	CTF1	Q16619	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	LINC00473	A8K010	186 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549		G3V318	75 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	CD33	P20138	364 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	VBP1	P61758	197 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	RUNX1	Q01196	453 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	SNAPC3	Q92966	411 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GABPB2-206	ENST00000489549	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	APOA1	P02647	267 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	NAT1	P18440	290 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	TAS2R20	P59543	309 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	CBX3	Q13185	183 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	FHL3	Q13643	280 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	PLGLA	Q15195	96 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	BVES	Q8NE79	360 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	HARBI1	Q96MB7	349 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GABPB2-206	ENST00000489549	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64

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