RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1W2PPE3	182 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	LINC00473	A8K010	186 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	LEUTX	A8MZ59	168 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529		M0R1X1	148 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	PFDN1	O60925	122 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	ATG12	O94817	140 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	SERPINE2	P07093	398 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	RRAS	P10301	218 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A6	P12236	298 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	VDAC1	P21796	283 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	MC5R	P33032	325 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM3	P40198	252 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	GZMK	P49863	264 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	GNG10	P50151	68 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	BPIFB3	P59826	476 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	IL15RA	Q13261	267 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	SP6	Q3SY56	376 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	LIN54	Q6MZP7	749 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	PNKD	Q8N490	385 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	TNFSF12	O43508	249 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	CCNK	O75909	580 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	HPRT1	P00492	218 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	EPHA1	P21709	976 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	HTR1D	P28221	377 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	H2BFS	P57053	126 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	RAP2B	P61225	183 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	POU2AF1	Q16633	256 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	MIDN	Q504T8	468 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM219A	Q8IW50	185 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51H1	Q8NH63	302 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529		Q96MF0	132 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF5	Q99942	180 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	IFNA21	P01568	189 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV1-39	P01597	117 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529		P0C879	139 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	FOSL1	P15407	271 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	LPAR6	P43657	344 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	GPHA2	Q96T91	129 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	NMES1	Q9C002	83 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	AUP1	Q9Y679	476 aa		10.33	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GU03	582 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	SNAPC5	O75971	98 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	NMS	Q5H8A3	153 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		10.32	□□□□□ -0.76
TRAF4-208	ENST00000469529	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		10.32	□□□□□ -0.76

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