RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468108.1

CCDC66-211, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-211	ENST00000468108	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108		F8W036	122 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	GOSR1	O95249	250 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HAND1	O96004	215 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IFNA2	P01563	188 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PMP2	P02689	132 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CSN2	P05814	226 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FCGR3A	P08637	254 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PSG2	P11465	335 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FOLR2	P14207	255 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IRF2	P14316	349 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PGAM2	P15259	253 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF44	P15621	663 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PRDX2	P32119	198 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PCP4	P48539	62 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RAB5C	P51148	216 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CAV2	P51636	162 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	F2RL1	P55085	397 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PAX5	Q02548	391 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HFE	Q30201	348 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RNF212	Q495C1	297 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MUC15	Q8N387	334 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	LRRC29	Q8WV35	223 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RDH5	Q92781	318 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108		Q9N2K0	584 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SIRPB1	O00241	398 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	WNT9B	O14905	357 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FSTL3	O95633	263 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	DIRAS3	O95661	229 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IFNA21	P01568	189 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	S100A8	P05109	93 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SULT1A2	P50226	295 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PPOX	P50336	477 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	RAB13	P51153	203 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CTAG1A	P78358	180 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CCL8	P80075	99 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	IL15RA	Q13261	267 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	ZNF561	Q8N587	486 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SDSL	Q96GA7	329 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC66-211	ENST00000468108	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73

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