RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF5Q99942 180 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 COA4Q9NYJ1 87 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ITGB1BP1O14713 200 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SHOXO15266 292 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV1-16P04430 117 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RANBP1P43487 201 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP2K4P45985 399 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LGALS7P47929 136 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM50BP56557 158 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ARFRP1Q13795 201 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TATDN3Q17R31 274 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 IGSF11Q5DX21 431 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RNLSQ5VYX0 342 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PDPNQ86YL7 162 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF383Q8NA42 475 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 POC5Q8NA72 575 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 BVESQ8NE79 360 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC7Q8TAX7 377 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB3CQ96E17 227 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RHOVQ96L33 236 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GINS4Q9BRT9 223 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 AGMATQ9BSE5 352 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR2D2Q9H210 308 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 HSF4Q9ULV5 492 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 STUB1Q9UNE7 303 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 V9GY05 133 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0G2JLM5 398 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PDCD5O14737 125 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FABP7O15540 132 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PROP1O75360 226 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GSTT2P0CG29 244 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GSTT2BP0CG30 244 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 LYL1P12980 280 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZP3P21754 424 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GADD45AP24522 165 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMD7P51665 324 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 AQP4P55087 323 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 FABP5Q01469 135 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 DEFA5Q01523 94 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TPBGQ13641 420 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TNXAQ16473 311 aa6.59□□□□□ -1.35
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SH3BP1-204ENST00000459646 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 PTX4Q96A99 478 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 HARBI1Q96MB7 349 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 GFI1Q99684 422 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 MGLLQ99685 303 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 TUBA4BQ9H853 241 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB22AQ9UL26 194 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-204ENST00000459646 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 MSGN1A6NI15 193 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SPDEFO95238 335 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 GNB3P16520 340 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SERPINB10P48595 397 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNJ2BPP57105 145 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 PLA2G7Q13093 441 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 IRF3Q14653 427 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 TNCP24821 2201 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 SMIM30A4D0T7 59 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 H0Y980 276 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 LDLRAD4O15165 306 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 ACTL6BO94805 426 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 CRYZL1O95825 349 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 FCGR3AP08637 254 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 CD37P11049 281 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 MYL9P24844 172 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-204ENST00000459646 OR10A3P58181 314 aa6.57□□□□□ -1.36
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