RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 STPG2Q8N412 459 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR2D2Q9H210 308 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP27Q9H306 513 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.84□□□□□ -0.99
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRHO14718 337 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HPGDSO60760 199 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV2-23P01705 113 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1-16P04430 117 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR5H8P0DN80 308 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RRASP10301 218 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CNTFRP26992 372 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 THBS3P49746 956 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMDQ15546 238 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LIN54Q6MZP7 749 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GON7Q9BXV9 100 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.83□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LINC00473A8K010 186 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BMQ9 156 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 M0R1X1 148 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC6A1P30531 599 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DYRK1AQ13627 763 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CDK10Q15131 360 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSG5Q15238 335 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ISOC1Q96CN7 298 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SOSTQ9BQB4 213 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OR51J1Q9H342 316 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFP57Q9NU63 452 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SCOCQ9UIL1 159 aa8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMB11A5LHX3 300 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FCN1O00602 326 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTDSP2O14595 271 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PEX14O75381 377 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPYP01298 95 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGLV1-40P01703 118 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGHG4P01861 327 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 APOA2P02652 100 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OPN1MWP04001 364 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ELANEP08246 267 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FCGR2CP31995 323 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ABHD1Q96SE0 405 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RABL2BQ9UNT1 228 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PLXNB1O43157 2135 aa8.81□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H7C2Y5 167 aa8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TSPAN15O95858 294 aa8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CSF1P09603 554 aa8.8□□□□□ -1
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AADACP22760 399 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms