RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431803.2

CDC42-IT1-201, CDC42 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CDC42-IT1, Length 692 nt, Biotype sense intronic.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRAM1Q15629 374 aa7.25□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RAB11BQ15907 218 aa7.25□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ACTBL2Q562R1 376 aa7.25□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ASCL2Q99929 193 aa7.25□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARL6IP5O75915 188 aa7.24□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PDPNQ86YL7 162 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 LFNGQ8NES3 379 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 NRG4Q8WWG1 115 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ARPC1AQ92747 370 aa7.24□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 LYSTQ99698 3801 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PECRQ9BY49 303 aa7.24□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.24□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.24□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 TRDCB7Z8K6 153 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C3orf84H3BNL1 204 aa7.23□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 RGS10O43665 173 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGHV3-11P01762 117 aa7.23□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 GP9P14770 177 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 CLDN12P56749 244 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 TPPP2P59282 170 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FABP5Q01469 135 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PLA2G7Q13093 441 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR4A4PQ8NGN8 299 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.23□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CLCC1Q96S66 551 aa7.23□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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CDC42-IT1-201ENST00000431803 BRI3O95415 125 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 DIRAS3O95661 229 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 IGLV2-23P01705 113 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 APOA2P02652 100 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRYGBP07316 175 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FCGR3AP08637 254 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CRHBPP24387 322 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 CD40LGP29965 261 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 FXYD3Q14802 87 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 ZNF124Q15973 351 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 PRSS48Q7RTY5 328 aa7.22□□□□□ -1.25
CDC42-IT1-201ENST00000431803 POC5Q8NA72 575 aa7.22□□□□□ -1.25
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