RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 OR2D2Q9H210 308 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 METRNQ9UJH8 293 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 C17orf100A8MU93 164 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SYNGR2O43760 224 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SSSCA1O60232 199 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 CRYZL1O95825 349 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1-39P01597 117 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1D-39P04432 117 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 DANCRP0C864 163 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 CGB3P0DN86 165 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 CGB7P0DN87 165 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DS2P43631 304 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SULT1A1P50225 295 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 BSPH1Q075Z2 132 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 MORN2Q502X0 79 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 MIDNQ504T8 468 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 Q5PR19 223 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 STUMQ69YW2 141 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SPAG16Q8N0X2 631 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 AGMATQ9BSE5 352 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 FAM24AA6NFZ4 105 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LGALS8O00214 317 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 RAB29O14966 203 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SIGLEC5O15389 551 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV1-5P01602 117 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SSTR5P35346 364 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 NHLH2Q02577 135 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 EDDM3AQ14507 147 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 BTNL8Q6UX41 500 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00052Q96N35 136 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 GPHA2Q96T91 129 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 WFDC1Q9HC57 220 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 GNG12Q9UBI6 72 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 CLN8Q9UBY8 286 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 CACNG5Q9UF02 275 aa8.31□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0G2JRQ6 117 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 hADV38S2A0JD32 116 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 IGSF23A1L1A6 192 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM218A2RU14 115 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 INAFM1C9JVW0 142 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 TXNL1O43396 289 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 FBXO24O75426 580 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 HPRT1P00492 218 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 P0C879 139 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 GPR12P47775 334 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 PAX9P55771 341 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 EDDM3BP56851 147 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LOXL3P58215 753 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 HBG1P69891 147 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 HBG2P69892 147 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 EFNB3Q15768 340 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 MST1LQ2TV78 715 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 Q3ZCU0 254 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LFNGQ8NES3 379 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 UBALD1Q8TB05 177 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01560Q8TB33 94 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 Q96MF0 132 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 ATP5SQ99766 215 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
POLR1A-204ENST00000424089 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.3□□□□□ -1.08
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