RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR8U1Q8NH10 309 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYYR1Q96J86 154 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFT46Q9NQC8 304 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLXNB1O43157 2135 aa6.77□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SSX5O60225 188 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPAN15O95858 294 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHG4P01861 327 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PF4V1P10720 104 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS3P35030 304 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIR2DS2P43631 304 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMBIM6P55061 237 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 F2RL1P55085 397 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VBP1P61758 197 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLGLAQ15195 96 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTF1Q16619 201 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM177Q53S58 311 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 R3HDM4Q96D70 268 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM68Q96MH6 324 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR51J1Q9H342 316 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.76□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PROP1O75360 226 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PF4P02776 101 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAT1P18440 290 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBPP20226 339 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD40LGP29965 261 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAS2R20P59543 309 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFHR3Q02985 330 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK10Q15131 360 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACTBL2Q562R1 376 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCTD9Q7L273 389 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF383Q8NA42 475 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HARBI1Q96MB7 349 aa6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNCP24821 2201 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H3BUA1 57 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SHOXO15266 292 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPYP01298 95 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGKV1-16P04430 117 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGF2P09038 288 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMB8P28062 276 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 S100GP29377 79 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RCVRNP35243 200 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGFBR1P36897 503 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CATR1Q13166 79 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSG5Q15238 335 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX45Q8NA69 505 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.74□□□□□ -1.33
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms