RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa16.39■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa16.38■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 IGKV1-5P01602 117 aa16.38■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 CT45A6P0DMU7 189 aa16.38■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 CT45A5P0DMU8 189 aa16.38■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 CT45A7P0DMV0 189 aa16.38■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa16.38■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.38■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 S1PR3Q99500 378 aa16.37■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.37■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 NMES1Q9C002 83 aa16.37■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 G6PCP35575 357 aa16.36■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 OR4P4Q8NGL7 312 aa16.36■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 IL22RA2Q969J5 263 aa16.35■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 30.1
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ODC1-202ENST00000405333 KCNAB3O43448 404 aa16.35■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa16.35■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa16.35■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 KPTNQ9Y664 436 aa16.35■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 ITPR3Q14573 2671 aa16.34■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 IGKV1-16P04430 117 aa16.34■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 SLC25A16P16260 332 aa16.34■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 ZNF137PP52743 207 aa16.34■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.34■□□□□ 0.21
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ODC1-202ENST00000405333 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 THBS3P49746 956 aa16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 BEND2Q8NDZ0 799 aa16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 TMEM186Q96B77 213 aa16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa16.33■□□□□ 0.21
ODC1-202ENST00000405333 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa16.33■□□□□ 0.2
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ODC1-202ENST00000405333 CRYZL1O95825 349 aa16.33■□□□□ 0.2
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