RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

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Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.68□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV1-40P01703 118 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 HLA-DQB1P01920 261 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CNTFRP26992 372 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMB8P28062 276 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PPIFP30405 207 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ARPC4P59998 168 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CX3CL1P78423 397 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PSG5Q15238 335 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MSMO1Q15800 293 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM177Q53S58 311 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 HOGA1Q86XE5 327 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF383Q8NA42 475 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 BEST4Q8NFU0 473 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 BORCS5Q969J3 196 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXL15Q9H469 300 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PARP11Q9NR21 331 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.67□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 G3V4G9 280 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL24O00175 119 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SHOXO15266 292 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V0E1O15342 81 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 WIPF1O43516 503 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SSX5O60225 188 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TUSC2O75896 110 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 APOA1P02647 267 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 IGKV1-16P04430 117 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RUNX1Q01196 453 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TEX45Q8NA69 505 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 DPF1Q92782 380 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 P2RX4Q99571 388 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 VSIG4Q9Y279 399 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 SORL1Q92673 2214 aa6.66□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 H3BUA1 57 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TPPPO94811 219 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 CNIH1O95406 144 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 KIR2DS2P43631 304 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB9AP51151 201 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 RORCP51449 518 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ACTBL2Q562R1 376 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 MZT2AQ6P582 158 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 BVESQ8NE79 360 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.65□□□□□ -1.34
MT-TS1-201ENST00000387416 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.65□□□□□ -1.34
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