RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384508.1

RNU6-110P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 110, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-110P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-110P-201ENST00000384508 TCAPO15273 167 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 PLA2G10O15496 165 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 NDUFA2O43678 99 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 PDE6DO43924 150 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 STX10O60499 249 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR2B3O76000 313 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ATG12O94817 140 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF682O95780 498 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CXorf1O96002 111 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SOD1P00441 154 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 IFNA1P01562 189 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 IFNA21P01568 189 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 IGLV3-27P01718 113 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 IGHV3-11P01762 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 HLA-DQA1P01909 254 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 HLA-DRB1P01911 266 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 TTRP02766 147 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 HLA-DQB2P05538 268 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SERPINA7P05543 415 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CRYBA1P05813 215 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CRHP06850 196 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR5G3P0C626 314 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR56A5P0C7T3 313 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 LINC00869P0C866 280 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SMIM17P0DL12 118 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 IGHV1-8P0DP01 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCL3P10147 92 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CD79AP11912 226 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF32P17041 273 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 GABRR1P24046 479 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CDK2P24941 298 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 PSMB9P28065 219 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CD34P28906 385 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CRABP1P29762 137 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SERPINB1P30740 379 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OPRK1P41145 380 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 MAGEA12P43365 314 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR1E2P47887 323 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CXCL12P48061 93 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SERPINB10P48595 397 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 INPP1P49441 399 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 UBE2AP49459 152 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 INSL3P51460 131 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 MNAT1P51948 309 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 RAP1GDS1P52306 607 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC18A1P54219 525 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 TPI1P60174 286 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 KRTAP10-11P60412 298 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 GABARAPL2P60520 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 FGF12P61328 243 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 DAD1P61803 113 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 RHOBP62745 196 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 GNG5P63218 68 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 FABP5Q01469 135 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 FOXF1Q12946 379 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 EDDM3AQ14507 147 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CST6Q15828 149 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF79Q15937 498 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 HIST3H3Q16695 136 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 DEFB116Q30KQ4 102 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 LINC00483Q53H64 154 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 C2orf83Q53S99 150 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM78AQ5JUQ0 283 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 C9orf64Q5T6V5 341 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 TMEM78Q5T7P6 136 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 Q5W150 140 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 Q5XG85 94 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM104BQ5XKR9 115 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM71E1Q6IPT2 247 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 NANOGP8Q6NSW7 305 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 C3orf33Q6P1S2 294 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SCGB1D4Q6XE38 83 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZFP2Q6ZN57 461 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 TIFABQ6ZNK6 161 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 Q6ZTC4 211 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 PEX26Q7Z412 305 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 LRP11Q86VZ4 500 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 DHFR2Q86XF0 187 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 PCP2Q8IVA1 136 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF695Q8IW36 515 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD29Q8N6D5 301 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 DAND5Q8N907 189 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR9A2Q8NGT5 310 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR4K13Q8NH42 304 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-110P-201ENST00000384508 LINC01560Q8TB33 94 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms