RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 SYNGR1O43759 233 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 LEPROTL1O95214 131 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TOMM40O96008 361 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TMEM74BQ9NUR3 256 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 LCTP09848 1927 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 J3KT08 172 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 LINC00869P0C866 280 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 IFITM1P13164 125 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 IGFBP2P18065 325 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CBLN1P23435 193 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 LIM2P55344 173 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 RTL8BQ17RB0 113 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC16A11Q8NCK7 471 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 OR8B2Q96RD0 313 aa11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MMP23AO75900 390 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 RAE1P78406 368 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 HMGN4O00479 90 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 FMODQ06828 376 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PRR13Q9NZ81 148 aa11.88□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 A0A0J9YW62 118 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 IL11RAQ14626 422 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 RTTNQ86VV8 2226 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SRIP30626 198 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CAMPP49913 170 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PIGTQ969N2 578 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TRAV27A0A087WT01 109 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PSMB11A5LHX3 300 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 APCSP02743 223 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC35E2P0CK97 266 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 OR10A2Q9H208 303 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ARRDC5A6NEK1 342 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 OOEPA6NGQ2 149 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MSGN1A6NI15 193 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TNFSF11O14788 317 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TMEM126AQ9H061 195 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC52A3Q9NQ40 469 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF319Q9P2F9 582 aa11.87□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TMEM212A6NML5 194 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 COX5AP20674 150 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 C19orf48Q6RUI8 117 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 H3BP45 60 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MPDU1O75352 247 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 EML2O95834 649 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CA7P43166 264 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MFAP5Q13361 173 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 A0A1W2PR80 420 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CRYAAP02489 173 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CD1AP06126 327 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 IGF2-ASQ6U949 168 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC25A40Q8TBP6 338 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SOSTQ9BQB4 213 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.86□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ANK1P16157 1881 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 LGALS7P47929 136 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC48A1Q6P1K1 146 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 K7EP34 96 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC2A10O95528 541 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 CSN3P07498 182 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 DDIT4LQ96D03 193 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa11.85□□□□□ -0.51
CTIF-202ENST00000382998 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms