RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35D1Q9NTN3 355 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 A3GALT2U3KPV4 340 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PPYP01298 95 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHG2P01859 326 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PMP2P02689 132 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 AADACP22760 399 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 LGALS7P47929 136 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 F2RL1P55085 397 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 HERV-K104P61576 105 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS16P62249 146 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 DHRS11Q6UWP2 260 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35E3Q7Z769 313 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB34Q8NCN2 500 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 NPBQ8NG41 125 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 OR6F1Q8NGZ6 308 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
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PGGT1B-202ENST00000379615 MMP27Q9H306 513 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-202ENST00000379615 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 WIPF1O43516 503 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DMAP28067 261 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 DUTP33316 252 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A5P33763 92 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 HRH1P35367 487 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 RFX2P48378 723 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TSPAN5P62079 268 aa12.2□□□□□ -0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf64Q2M2E5 130 aa12.2□□□□□ -0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 LYSMD2Q8IV50 215 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CHPT1Q8WUD6 406 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 SECTM1Q8WVN6 248 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD1Q96SE0 405 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MTFP1Q9UDX5 166 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MGAM2Q2M2H8 2515 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 GABARAPH6UMI1 98 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 M0QZ24 198 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 AP4M1O00189 453 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 RRHO14718 337 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO24O75426 580 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA3O95167 84 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 SPDEFO95238 335 aa12.19□□□□□ -0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.19□□□□□ -0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 FXYD4P59646 89 aa12.19□□□□□ -0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF66Q6ZN08 573 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM17Q86X19 198 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52I2Q8NH67 350 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 ANK2Q01484 3957 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 FABP12A6NFH5 140 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CTDSPLO15194 276 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 HLA-DRB1P01911 266 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV1-16P04430 117 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFSF8P32971 234 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP10-3P60369 221 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 LPCAT3Q6P1A2 487 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 KCTD9Q7L273 389 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 BVESQ8NE79 360 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OR5AU1Q8NGC0 362 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4X2Q8NGF9 303 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf30Q96GV9 206 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 RITA1Q96K30 269 aa12.18□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 KLK11Q9UBX7 282 aa12.18□□□□□ -0.46
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PGGT1B-202ENST00000379615 CNTFRP26992 372 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 S100GP29377 79 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR2DS2P43631 304 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00205P59089 165 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CATR1Q13166 79 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 PSG5Q15238 335 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM177Q53S58 311 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 VAX1Q5SQQ9 334 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 COMMD1Q8N668 190 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM4Q8WVI0 70 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 DDB2Q92466 427 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 MOB3AQ96BX8 217 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 HARBI1Q96MB7 349 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL28Q9NRJ3 127 aa12.17□□□□□ -0.46
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