RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.04□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 LINC01548A6NM66 108 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT19A8MXV4 375 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 BET1O15155 118 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 IGLL1P15814 213 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 S100A5P33763 92 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R20P59543 309 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ACTBP60709 375 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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SGMS1-201ENST00000361543 ACTBL2Q562R1 376 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TEX38Q6PEX7 206 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 REC114Q7Z4M0 266 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 HOGA1Q86XE5 327 aa6.03□□□□□ -1.44
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SGMS1-201ENST00000361543 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.03□□□□□ -1.44
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SGMS1-201ENST00000361543 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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SGMS1-201ENST00000361543 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 GON7Q9BXV9 100 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.03□□□□□ -1.44
SGMS1-201ENST00000361543 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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SGMS1-201ENST00000361543 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.03□□□□□ -1.44
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SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DRB1P01911 266 aa6.02□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.02□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.02□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.02□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 TENM3Q9P273 2699 aa6.01□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 RBBP9O75884 186 aa6.01□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 GSTT2BP0CG30 244 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR5H8P0DN80 308 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RRASP10301 218 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ELK1P19419 428 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 S100GP29377 79 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 THBS3P49746 956 aa6.01□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM17Q86X19 198 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF695Q8IW36 515 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RNF152Q8N8N0 203 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RITA1Q96K30 269 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RHOVQ96L33 236 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 AGMATQ9BSE5 352 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PARP11Q9NR21 331 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1456Q9P272 454 aa6.01□□□□□ -1.45
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