RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 RAB9BQ9NP90 201 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 CDS2O95674 445 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 SNCAP37840 140 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 ZNF273Q14593 569 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 BVESQ8NE79 360 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 C14orf79Q96F83 325 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 ZNF714Q96N38 554 aa9.67□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 DBX1A6NMT0 343 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 B9A039 149 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 MMP23AO75900 390 aa9.66□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 UCP1P25874 307 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 UTF1Q5T230 341 aa9.66□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 TACC2O95359 2948 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 M0R036 132 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 BTN1A1Q13410 526 aa9.66□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 STUMQ69YW2 141 aa9.66□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 ZNF561Q8N587 486 aa9.66□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.66□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.66□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 MARCH11A6NNE9 402 aa9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 LINC00473A8K010 186 aa9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 MORN2Q502X0 79 aa9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 Q8NFD4 153 aa9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 ZNF737O75373 536 aa9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 IGHV3-48P01763 117 aa9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 ZNF266Q14584 549 aa9.65□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
HPS1-204ENST00000361490 HILPDAQ9Y5L2 63 aa9.65□□□□□ -0.86
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HPS1-204ENST00000361490 HAGHQ16775 308 aa9.64□□□□□ -0.87
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HPS1-204ENST00000361490 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.64□□□□□ -0.87
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HPS1-204ENST00000361490 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.63□□□□□ -0.87
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HPS1-204ENST00000361490 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 OR13C7P0DN81 318 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 ZNF134P52741 427 aa9.63□□□□□ -0.87
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HPS1-204ENST00000361490 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 C17orf50Q8WW18 174 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 DIRC2Q96SL1 478 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 ZNF835Q9Y2P0 537 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 FLNCQ14315 2725 aa9.63□□□□□ -0.87
HPS1-204ENST00000361490 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.63□□□□□ -0.87
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