RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00205P59089 165 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TLE4Q04727 773 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SSX7Q7RTT5 188 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF525Q8N782 197 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 RAB39BQ96DA2 213 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 HIST1H2BLQ99880 126 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 OR2D2Q9H210 308 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CADP27708 2225 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 PRSS47A8MTI9 375 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 M0R143 59 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IGHG3P01860 377 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM11P17152 192 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TDGF1P3P51864 188 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 Q8WTZ3 238 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 HES4Q9HCC6 221 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 KRASP01116 189 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TRGC1P0CF51 173 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GUSBP1Q15486 140 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LCN15Q6UWW0 184 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 LRP11Q86VZ4 500 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 OR5R1Q8NH85 324 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GNG13Q9P2W3 67 aa13.73□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 G6PCP35575 357 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CD81P60033 236 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF726P1Q15940 193 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB124Q8NES8 71 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 COQ2Q96H96 371 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 TCF21O43680 179 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV3-15P01624 115 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF429Q86V71 674 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GALMQ96C23 342 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 SNX22Q96L94 193 aa13.72□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 HBZP02008 142 aa13.71□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 GABRA2P47869 451 aa13.71□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 RFESDQ8TAC1 157 aa13.71□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 OR4C12Q96R67 309 aa13.71□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF665Q9H7R5 613 aa13.71□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 CACNA1GO43497 2377 aa13.71□□□□□ -0.21
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM210A6NLX4 147 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ZFP92A6NM28 416 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CECR9P0C854 216 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 GLIPR1P48060 266 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 UBE2KP61086 200 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 WDR82Q6UXN9 313 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 FRZBQ92765 325 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MUCL1Q96DR8 90 aa13.71□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SSTR5P35346 364 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RPS16P62249 146 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DLK1P80370 383 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 NCR3LG1Q68D85 454 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ACP7Q6ZNF0 438 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 YPEL4Q96NS1 127 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DEFB108AA8MXU0 73 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CD55P08174 381 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 HOXC12P31275 282 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ERVFRD-1P60508 538 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DNLZQ5SXM8 178 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 RBKSQ9H477 322 aa13.7□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 C17orf98A8MV24 154 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN1O95832 211 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ELLP55199 621 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 ABHD5Q8WTS1 349 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 S1PR2O95136 353 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 HBE1P02100 147 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 COX5AP20674 150 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.69□□□□□ -0.22
SHQ1-201ENST00000325599 DPPA3Q6W0C5 159 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms