RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 ODF3BA8MYP8 253 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 KIR2DS2P43631 304 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 H2BFSP57053 126 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 KLRD1Q13241 179 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF585BQ52M93 769 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 DDB2Q92466 427 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TBX15Q96SF7 602 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CR1P17927 2039 aa16.01■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 VPS13CQ709C8 3753 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CCSO14618 274 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ADAP1O75689 374 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 OR2A4O95047 310 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 HOXB5P09067 269 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 GATA3P23771 443 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 LINC00205P59089 165 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CD300CQ08708 224 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 DCAF12L2Q5VW00 463 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 SLC35G3Q8N808 338 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ASB13Q8WXK3 278 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 OR2A7Q96R45 310 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 SIX6O95475 246 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 IFNA21P01568 189 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ARG1P05089 322 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 BRWD1-AS2P59051 145 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 OR2B11Q5JQS5 317 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 GSG1LQ6UXU4 331 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 LYZL2Q7Z4W2 148 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R14BQ96C90 147 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TMED3Q9Y3Q3 217 aa16■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RAMP3O60896 148 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CT45A6P0DMU7 189 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CT45A5P0DMU8 189 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CT45A7P0DMV0 189 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 LPAR6P43657 344 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TCTE3Q8IZS6 198 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF383Q8NA42 475 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CREBBPQ92793 2442 aa15.99■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 C5orf51A6NDU8 294 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 FAM25EA8MYX2 175 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 HTR1DP28221 377 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RAP2BP61225 183 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 GGNBP1Q5YKI7 109 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 HIF1ANQ9NWT6 349 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC168Q8NDH2 2452 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 LY6LH3BQJ8 138 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TXNL1O43396 289 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 FCGR3BO75015 233 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 IGKV1-39P01597 117 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 IGKV1D-39P04432 117 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 VDAC1P21796 283 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 UBE2E1P51965 193 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 WFDC11Q8NEX6 87 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 OR4S2Q8NH73 311 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CHIAQ9BZP6 476 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 DPM3Q9P2X0 92 aa15.98■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 LEUTXA8MZ59 168 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 CEACAM3P40198 252 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 REG1BP48304 166 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 LHX4Q969G2 390 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RPEQ96AT9 228 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 NABP2Q9BQ15 211 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHA2Q9HB19 425 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 AUP1Q9Y679 476 aa15.97■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 ATG12O94817 140 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 S1PR2O95136 353 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 HPRT1P00492 218 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 APOA2P02652 100 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 GZMKP49863 264 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 RTL8BQ17RB0 113 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.96■□□□□ 0.15
CCDC71-201ENST00000321895 MPTX1A8MV57 137 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC71-201ENST00000321895 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC71-201ENST00000321895 RRASP10301 218 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC71-201ENST00000321895 CYCSP99999 105 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC71-201ENST00000321895 NMSQ5H8A3 153 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC71-201ENST00000321895 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa15.95■□□□□ 0.14
CCDC71-201ENST00000321895 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CCDC71-201ENST00000321895 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms