RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 DTX2Q86UW9 622 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 MT-ND6P03923 174 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 PIGYQ3MUY2 71 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 HCP5Q6MZN7 132 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 MMD2Q8IY49 270 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 AMER3Q8N944 861 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 OR5A1Q8NGJ0 315 aa10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 KLK8O60259 260 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00869P0C866 280 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 DCAF10Q5QP82 559 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 NKX2-6A6NCS4 301 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 GFRA3O60609 400 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 GCSAMQ8N6F7 178 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 SOCS1O15524 211 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 MARVELD3Q96A59 401 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 C9JCJ5 164 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 PITX3O75364 302 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 NPPCP23582 126 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 PRR32B1ATL7 298 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 RPL8P62917 257 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF407-201ENST00000299687 A0A1W2PQD3 144 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 LIPT2A6NK58 231 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 MESTQ5EB52 335 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PMS2CLQ68D20 193 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PGPA6NDG6 321 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CD1AP06126 327 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 IL9P15248 144 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 INSL4Q14641 139 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PLCE1Q9P212 2302 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 NDUFB4O95168 129 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 HLA-DQA1P01909 254 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CTSSP25774 331 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 OR4X2Q8NGF9 303 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 A0A1W2PPE3 182 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PRR33A8MZF0 331 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 DLL1O00548 723 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 AMY1AP04745 511 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CBLN2Q8IUK8 224 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 C7orf66A4D0T2 115 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 GTSCR1Q86UQ5 136 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 NEU3Q9UQ49 428 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PAPPAQ13219 1627 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CACNA1EQ15878 2313 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 DNM1P46Q6ZS02 220 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 OR2K2Q8NGT1 345 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 VCX2Q9H322 139 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 HMX2A2RU54 273 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 LIFP15018 202 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 LEMD1Q68G75 181 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CCL13Q99616 98 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PLCH1Q4KWH8 1693 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 EDIL3O43854 480 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 ASAH2BP0C7U1 165 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 THADAQ6YHU6 1953 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 FTH1P19P0C7X4 201 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CRYBB2P43320 205 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 TTTY12Q9BZ98 90 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CTSVO60911 334 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 NAT1P18440 290 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF645Q8N7E2 425 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 SHISA4Q96DD7 197 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 LOXL4Q96JB6 756 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 SERF2P84101 59 aa10.62□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 DUX3Q96PT4 197 aa10.62□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 A0A0G2JLM5 398 aa10.62□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 CRHP06850 196 aa10.62□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 SOD3P08294 240 aa10.62□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa10.62□□□□□ -0.71
ZNF407-201ENST00000299687 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms