RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21863J3KMP8 111 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PhyhO35386 338 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sdc1P18828 311 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irf2P23906 349 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sftpa1P35242 248 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TspoP50637 169 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pip5k1aP70182 546 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lhfpl4Q5U4E0 247 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SdhaQ8K2B3 664 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PurgQ8R4E6 350 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1270Q8VGP3 304 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Osr2Q91ZD1 312 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Galnt11Q921L8 608 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9DAN9 164 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Naa60Q9DBU2 242 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Med13Q5SWW4 2171 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-34A0A075B5V2 117 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10778A0A087WNP5 499 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm7697A0A0J9YUH2 350 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9495A0A0J9YUZ3 350 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm2026A2ART4 498 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn2r82G3UWA2 865 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r80L7N1Z3 308 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Serf1O88892 62 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GzmbP04187 247 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Coq3Q8BMS4 370 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Abhd12Q99LR1 398 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam96bQ9D187 163 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nat8Q9JIY7 227 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hils1Q9QYL0 170 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Apc2Q9Z1K7 2274 aa11.67□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RnlsA7RDN6 342 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1700031F05RikB1AX30 191 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm7233E9PZI8 198 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr178E9Q9T3 319 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9732F6QVC4 198 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr635K7N6B1 321 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm8104K7N744 198 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lsm5P62322 91 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc2a9Q3T9X0 538 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Epha5Q60629 876 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ifna15Q61718 190 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ahsa1Q8BK64 338 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr279Q8VFD8 310 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q8WUR0 141 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Egln1Q91YE3 400 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc29a3Q99P65 475 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgf16Q9ESL8 207 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankdd1aA0A1L1ST07 508 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TectbO08524 329 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Alox12bO70582 701 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Evx1P23683 416 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Efnb2P52800 336 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem71Q149F5 287 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr469Q8VF66 314 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1342Q8VFY3 315 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nmnat3Q99JR6 245 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem216Q9CQC4 141 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp1r27Q9D119 154 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fscn3Q9QXW4 498 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Heatr1G3X9B1 2143 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 TprF6ZDS4 2431 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fgf12P61329 243 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fndc4Q3TR08 231 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A3galt2Q3V1N9 370 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 JkampQ8BI36 311 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf672Q99LH4 468 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DohhQ99LN9 302 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm9817Q9D2M0 144 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kcnip1Q9JJ57 227 aa11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Suclg1Q9WUM5 346 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cacna1aP97445 2368 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv6-5A0A0A6YWS9 119 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igkv5-37A0A140T8N4 115 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4930467E23RikD3Z1P8 350 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A630073D07RikE9PWS6 100 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr554E9Q546 317 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15319E9Q637 350 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr69E9Q7C5 316 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 9130019O22RikG3X941 543 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SelenohQ3UQA7 116 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Msl2Q69ZF8 577 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 SergefQ80YD6 464 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21119Q8C646 350 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vrk3Q8K3G5 453 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1424Q8VFV1 313 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr133Q8VG94 312 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnajb11Q99KV1 358 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mrps24Q9CQV5 167 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Alkbh4Q9D8F1 300 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Irak1bp1Q9ESJ7 259 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Xcr1Q9R0M1 322 aa11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm12355A2A4X6 163 aa11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r5B2RQT2 315 aa11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15440D3Z3P4 90 aa11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Muc3E9PWP7 378 aa11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 180.7 ms