RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	TRGV3	P03979	118 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	TFAP2A	P05549	437 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	LYL1	P12980	280 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	ARSB	P15848	533 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	SRM	P19623	302 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	LFNG	Q8NES3	379 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	UFD1	Q92890	307 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	PTGES3L	E9PB15	166 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	NAPSA	O96009	420 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	GNAO1	P09471	354 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	ZP3	P21754	424 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	INSL4	Q14641	139 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	SPHAR	Q15513	63 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	PDPN	Q86YL7	162 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	AK3	Q9UIJ7	227 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0G2JLM5	398 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	FCN1	O00602	326 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	SOX15	O60248	233 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	CDK1	P06493	297 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	UNC119	Q13432	240 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	FXYD3	Q14802	87 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	PSG5	Q15238	335 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	P2RY14	Q15391	338 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB11B	Q15907	218 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TARDBP-231	ENST00000639599	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		M0R1X1	148 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A17	O43808	307 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TATDN3	Q17R31	274 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	CASC10	Q5T4H9	136 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	POC5	Q8NA72	575 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	PHB2	Q99623	299 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		H3BUA1	57 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SOCS1	O15524	211 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	CD3G	P09693	182 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	UCHL1	P09936	223 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	LGALS7	P47929	136 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINB10	P48595	397 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	VEGFC	P49767	419 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TRAM1	Q15629	374 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		Q9N2K0	584 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.32	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		H0Y980	276 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC17A2	O00624	439 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	MPPED1	O15442	326 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SCT	P09683	121 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	RTL8B	Q17RB0	113 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	RNLS	Q5VYX0	342 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms