RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PYDC2	Q56P42	97 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	DRAM2	Q6UX65	266 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM29	Q86T20	159 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SKA3	Q8IX90	412 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T27	Q8NH04	317 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF563	Q8TA94	476 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF721	Q8TF20	911 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF138	Q8WVD3	245 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM234	Q8WY98	164 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TSLP	Q969D9	159 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT9	Q9BW91	350 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		3.84	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NDN8	102 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf77	C9JDV5	145 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HPRT1	P00492	218 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CD8A	P01732	235 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GYPB	P06028	91 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CD14	P08571	375 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PGA4	P0DJD7	388 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PGA3	P0DJD8	388 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	COX6A1	P12074	109 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IL7	P13232	177 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF35	P13682	527 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CXCR1	P25024	350 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IL2RG	P31785	369 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PYCR1	P32322	319 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	EVX1	P49640	407 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SKP2	Q13309	424 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TGIF1	Q15583	401 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL9	Q6T311	187 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GHSR	Q92847	366 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NMNAT3	Q96T66	252 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	C12orf10	Q9HB07	376 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		V9GYH0	126 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SCN2A	Q99250	2005 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	NIN	Q8N4C6	2090 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		3.83	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQD3	144 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM25A	B3EWG3	89 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM25C	B3EWG5	89 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM25G	B3EWG6	89 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616		K7N7A8	449 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	HPGDS	O60760	199 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA5	P01569	189 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SERPINA7	P05543	415 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PATE4	P0C8F1	98 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PGA5	P0DJD9	388 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SPN	P16150	400 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SPI1	P17947	270 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	MYL9	P24844	172 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	TALDO1	P37837	337 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GALR1	P47211	349 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A1	P53007	311 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	GLO1	Q04760	184 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	INSL4	Q14641	139 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DS1	Q14954	304 aa		3.82	□□□□□ -1.8
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF79	Q15937	498 aa		3.82	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 186.7 ms