RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR5H14	A6NHG9	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179		H7C2Y5	167 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR8U9	P0C7N5	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	PF4V1	P10720	104 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	MC5R	P33032	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179		Q6ZS49	121 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	NPB	Q8NG41	125 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR8U1	Q8NH10	309 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179		M0R1X1	148 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SSX5	O60225	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SCGN	O76038	276 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	NDUFA3	O95167	84 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	DTYMK	P23919	212 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SCAND1	P57086	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	DIRAS3	O95661	229 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	HLA-DRB1	P01911	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	PF4	P02776	101 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	TFAP2A	P05549	437 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	GNG2	P59768	71 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	PITPNA	Q00169	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	LIN54	Q6MZP7	749 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	GON7	Q9BXV9	100 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	OR51J1	Q9H342	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PNKP-223	ENST00000629179		G3V318	75 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179		J3QRK9	145 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	FCN1	O00602	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	RRH	O14718	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	RBBP9	O75884	186 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	IGKV1-16	P04430	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	IGF1	P05019	195 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	CD33	P20138	364 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	VDAC1	P21796	283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	CFHR3	Q02985	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	GAB2	Q9UQC2	676 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	TG	P01266	2768 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	APOA2	P02652	100 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	PTHLH	P12272	177 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	FOXE3	Q13461	319 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	PLGLA	Q15195	96 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	PSG5	Q15238	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	CLCC1	Q96S66	551 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	RNF5	Q99942	180 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	PARP11	Q9NR21	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	DIABLO	Q9NR28	239 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	IGHG4	P01861	327 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	ELANE	P08246	267 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	SMIM18	P0DKX4	95 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	IGLL1	P15814	213 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PNKP-223	ENST00000629179	NCS1	P62166	190 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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