RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-208ENST00000587269 TMEM50BP56557 158 aa23.02■■□□□ 1.28
SMAD2-208ENST00000587269 HES5Q5TA89 166 aa23.02■■□□□ 1.28
SMAD2-208ENST00000587269 ZNF491Q8N8L2 437 aa23.02■■□□□ 1.28
SMAD2-208ENST00000587269 OR5B12Q96R08 314 aa23.02■■□□□ 1.28
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SMAD2-208ENST00000587269 H0YJW9 148 aa23.01■■□□□ 1.27
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SMAD2-208ENST00000587269 I3L521 148 aa22.96■■□□□ 1.27
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SMAD2-208ENST00000587269 PPP1R27Q86WC6 154 aa22.96■■□□□ 1.27
SMAD2-208ENST00000587269 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa22.95■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 BET1O15155 118 aa22.95■■□□□ 1.26
SMAD2-208ENST00000587269 INSL3P51460 131 aa22.95■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 CBX3Q13185 183 aa22.94■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 PSG5Q15238 335 aa22.94■■□□□ 1.26
SMAD2-208ENST00000587269 ACTBL2Q562R1 376 aa22.94■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 PDPNQ86YL7 162 aa22.94■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 CENPOQ9BU64 300 aa22.93■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 OR8U9P0C7N5 309 aa22.91■■□□□ 1.26
SMAD2-208ENST00000587269 GNB3P16520 340 aa22.91■■□□□ 1.26
SMAD2-208ENST00000587269 OR10A3P58181 314 aa22.91■■□□□ 1.26
SMAD2-208ENST00000587269 ARFRP1Q13795 201 aa22.91■■□□□ 1.26
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SMAD2-208ENST00000587269 ZNF383Q8NA42 475 aa22.91■■□□□ 1.26
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