RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581671.1

CTC1-208, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTC1, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-208ENST00000581671 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 NEK7Q8TDX7 302 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 ARPC1AQ92747 370 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 RNF183Q96D59 192 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 SCN3BQ9NY72 215 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 GNG12Q9UBI6 72 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 CKLFQ9UBR5 152 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 GHRLQ9UBU3 117 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 FAT1Q14517 4588 aa7.17□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 NAPSAO96009 420 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 HLA-DRB1P01911 266 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 OR8U9P0C7N5 309 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 HTR2CP28335 458 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 ACTBP60709 375 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 GNB1P62873 340 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 UNC119Q13432 240 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 HMGN3Q15651 99 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 AWAT2Q6E213 333 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 PRR18Q8N4B5 295 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 C18orf15Q96N68 181 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 OR4C12Q96R67 309 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 AGMATQ9BSE5 352 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 TM2D1Q9BX74 207 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 OR51J1Q9H342 316 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 GNB4Q9HAV0 340 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 RAB9BQ9NP90 201 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 JPT1Q9UK76 154 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.16□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 A0A0A6YYD4 124 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 A0A0J9YWU9 116 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 SOX15O60248 233 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 IGLV1-51P01701 117 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 CT45A6P0DMU7 189 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 CT45A5P0DMU8 189 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 CT45A7P0DMV0 189 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 OR3A3P47888 321 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 RAB9AP51151 201 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 ACSM3Q53FZ2 586 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 OR10K2Q6IF99 312 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 GALMQ96C23 342 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 GFI1Q99684 422 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.15□□□□□ -1.26
CTC1-208ENST00000581671 A0A087WXM4 84 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 C16orf90A8MZG2 172 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 FCN1O00602 326 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 ITGB1BP1O14713 200 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 SLC22A1O15245 554 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 ATP6V0E1O15342 81 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 CNIH1O95406 144 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 UBBP0CG47 229 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 OR5H8P0DN80 308 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 SRMP19623 302 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 VDAC1P21796 283 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 SLURP1P55000 103 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 TMEM50BP56557 158 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 NDPQ00604 133 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 IRF3Q14653 427 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 MMDQ15546 238 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 LIN54Q6MZP7 749 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 AHSA2Q719I0 299 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 PHYHIPQ92561 330 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 FAM46BQ96A09 425 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 OR5B12Q96R08 314 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 NICN1Q9BSH3 213 aa7.14□□□□□ -1.27
CTC1-208ENST00000581671 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms