RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579466.1

MSI2-208, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 186 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-208	ENST00000579466	DCK	P27707	260 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	FXYD3	Q14802	87 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SVOP	Q8N4V2	548 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	NICN1	Q9BSH3	213 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	COA4	Q9NYJ1	87 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		7.33	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SLC22A1	O15245	554 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	GPX5	O75715	221 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MC5R	P33032	325 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CD81	P60033	236 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	DYRK1A	Q13627	763 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	INSL4	Q14641	139 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RPEL1	Q2QD12	228 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	LCN12	Q6JVE5	192 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	DERL3	Q96Q80	235 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SHISA3	A0PJX4	238 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RBBP9	O75884	186 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ATP5H	O75947	161 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	BRI3	O95415	125 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	GLA	P06280	429 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CEACAM6	P40199	344 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	DEFB125	Q8N687	156 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF383	Q8NA42	475 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	BVES	Q8NE79	360 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TMEM80	Q96HE8	168 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PHB2	Q99623	299 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	LRRC42	Q9Y546	428 aa		7.31	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466		A0A0G2JLM5	398 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	IRGM	A1A4Y4	181 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466		M0R1X1	148 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TPPP	O94811	219 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SPDEF	O95238	335 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	APOA2	P02652	100 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CSN3	P07498	182 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CD7	P09564	240 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CEL	P19835	753 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	HTR2C	P28335	458 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	HLA-DRB3	P79483	266 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MED21	Q13503	144 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PMS2P11	Q13670	270 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466		Q8N402	240 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	IL17D	Q8TAD2	202 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	GGH	Q92820	318 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	NEURL2	Q9BR09	285 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF221	Q9UK13	617 aa		7.3	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466		H3BUA1	57 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MYL12B	O14950	172 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MPPED1	O15442	326 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PROP1	O75360	226 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	LY6G6C	O95867	125 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	NAPSA	O96009	420 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PRH1	P02810	166 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SCT	P09683	121 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	EDN2	P20800	178 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZBTB25	P24278	435 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	LGALS7	P47929	136 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	UNC119	Q13432	240 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	GUCA2B	Q16661	112 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TATDN3	Q17R31	274 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RNLS	Q5VYX0	342 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PDPN	Q86YL7	162 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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