RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 YPEL2Q96QA6 119 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 METTL9Q9H1A3 318 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 H3BNX3 289 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 J3QL48 77 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GABRPO00591 440 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GNGT2O14610 69 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 APOA2P02652 100 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MAS1P04201 325 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ISG15P05161 165 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR9G9P0C7N8 305 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR2T7P0C7T2 308 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 SERPINA2P20848 420 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-DMBP28068 263 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ARL3P36405 182 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 RIPK1Q13546 671 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZRM9 215 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZTC4 211 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GID4Q8IVV7 300 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 MARC2Q969Z3 335 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 GALMQ96C23 342 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 JAM3Q9BX67 310 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.09□□□□□ -1.27
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM213A2RRL7 107 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 OR4C46A6NHA9 309 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 ST8SIA5O15466 376 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 SNX3O60493 162 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC22O60826 627 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 HTR1AP08908 422 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CT45A6P0DMU7 189 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CT45A5P0DMU8 189 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CT45A7P0DMV0 189 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 HSD17B1P14061 328 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 RAB3AP20336 220 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 HTD2P86397 168 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CBX3Q13185 183 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 MED21Q13503 144 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM187Q14656 261 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 GPHB5Q86YW7 130 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 FAM46BQ96A09 425 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.08□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 A8MWP6 167 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00205P59089 165 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 TNP2Q05952 138 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 C15orf32Q32M92 178 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF585BQ52M93 769 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 TP53I3Q53FA7 332 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZR54 194 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 PDPNQ86YL7 162 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 NECAP1Q8NC96 275 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 IL1F10Q8WWZ1 152 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 HSPG2P98160 4391 aa7.07□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 PRKYO43930 277 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CA11O75493 328 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CDRT1O95170 752 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 FAM107AO95990 144 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CST1P01037 141 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 PRH1P02810 166 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 GTF2F2P13984 249 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 MYOD1P15172 320 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 TNXAQ16473 311 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 CGB2Q6NT52 195 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.5 ms