RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558516.1

CSH2-204, Transcript of chorionic somatomammotropin hormone 2, human

TSL 2

Gene CSH2, Length 1,172 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSH2-204	ENST00000558516	TXNL1	O43396	289 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TSPAN9	O75954	239 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	FCGR2C	P31995	323 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	DYNLT3	P51808	116 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ACTB	P60709	375 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CCDC190	Q86UF4	302 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	LINC01006	Q8NI28	216 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CITED1	Q99966	193 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516		V9GYH0	126 aa		11.45	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516		M0QYG6	137 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CTDSPL	O15194	276 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	LANCL1	O43813	399 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	AADAC	P22760	399 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	PROK1	P58294	105 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	HES1	Q14469	280 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516		Q6ZSV7	163 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CFHR4	Q92496	578 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	GHITM	Q9H3K2	345 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TUSC2	O75896	110 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	PPY	P01298	95 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CD3D	P04234	171 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	FXYD4	P59646	89 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ZNF79	Q15937	498 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516		A6NDX4	124 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516		M0R1X1	148 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CHST1	O43916	411 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ETV6	P41212	452 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TAS2R19	P59542	299 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	HERV-K104	P61576	105 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TSPAN5	P62079	268 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	LSAMP	Q13449	338 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	HNF4G	Q14541	408 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ACTBL2	Q562R1	376 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516		Q8N402	240 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	NABP2	Q9BQ15	211 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	PROP1	O75360	226 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	IFNA6	P05013	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CSF1	P09603	554 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CT45A6	P0DMU7	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CT45A5	P0DMU8	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CT45A7	P0DMV0	189 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TMEM11	P17152	192 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	LINC00205	P59089	165 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CSH2-204	ENST00000558516	CD1B	P29016	333 aa		11.4	□□□□□ -0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms