RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553570.5

ATXN3-222, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 757 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-222	ENST00000553570	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	RHOF	Q9HBH0	211 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	KIF25	Q9UIL4	384 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	SSR3	Q9UNL2	185 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1W2PPE3	182 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A1W2PPQ1	181 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ODAM	A1E959	279 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	CCRL2	O00421	344 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF737	O75373	536 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	GPX5	O75715	221 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	FBP1	P09467	338 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	FUT3	P21217	361 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	CDK2	P24941	298 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	SAA4	P35542	130 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	VEGFC	P49767	419 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	GNG10	P50151	68 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	PSMD7	P51665	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	UBE2E1	P51965	193 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	BPIFB3	P59826	476 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	GABARAPL2	P60520	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ELP2	Q6IA86	826 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	OR52W1	Q6IF63	320 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	C16orf87	Q6PH81	154 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF773	Q6PK81	442 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ASCL4	Q6XD76	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	C17orf50	Q8WW18	174 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	DYRK2	Q92630	601 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	LEAP2	Q969E1	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ARL11	Q969Q4	196 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	CST11	Q9H112	138 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ESM1	Q9NQ30	184 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	RNF150	Q9ULK6	438 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570		V9GY05	133 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570		A0A087WXM4	84 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570		H3BUX3	64 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	AIP	O00170	330 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	MMP23A	O75900	390 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	TNFAIP8	O95379	198 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	MELTF	P08582	738 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	UCHL1	P09936	223 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	UBB	P0CG47	229 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	CD36	P16671	472 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	RAB3B	P20337	219 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	GZMH	P20718	246 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	GADD45A	P24522	165 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	CD24	P25063	80 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	IER3	P46695	156 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	OR10A3	P58181	314 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	HILS1	P60008	231 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATXN3-222	ENST00000553570	SSX1	Q16384	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81

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