RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 SPATA25Q9BR10 227 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 HYDINQ4G0P3 5121 aa13.02□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 SLC22A1O15245 554 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 UBBP0CG47 229 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 HTR2CP28335 458 aa13□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 AGMATQ9BSE5 352 aa12.99□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 TUBA4BQ9H853 241 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 OR1A1Q9P1Q5 309 aa12.99□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 C1orf100Q5SVJ3 147 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 GTSCR1Q86UQ5 136 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 ZNF383Q8NA42 475 aa12.97□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 ZNF221Q9UK13 617 aa12.97□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 UNC119Q13432 240 aa12.96□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CS-214ENST00000548849 AK3Q9UIJ7 227 aa12.96□□□□□ -0.33
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CS-214ENST00000548849 TNCP24821 2201 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-214ENST00000548849 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
CS-214ENST00000548849 TMEM14DPA8MWL7 114 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-214ENST00000548849 M0R1X1 148 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-214ENST00000548849 JTBO76095 146 aa12.94□□□□□ -0.34
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CS-214ENST00000548849 DEFA5Q01523 94 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-214ENST00000548849 PJVKQ0ZLH3 352 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-214ENST00000548849 LCN12Q6JVE5 192 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-214ENST00000548849 AHSA2Q719I0 299 aa12.94□□□□□ -0.34
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