RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 LMO7DNF2Z398 122 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 ZNF32P17041 273 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 TIMP3P35625 211 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 OR1D5P58170 312 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 GNB1P62873 340 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RBX1P62877 108 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZRM9 215 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CALHM1Q8IU99 346 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 PRO3102Q9H379 93 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 FGF21Q9NSA1 209 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.17□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 C9JCJ5 164 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 FCN1O00602 326 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 NUPR1O60356 82 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 NDUFB4O95168 129 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1-39P01597 117 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1D-39P04432 117 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 GPX1P07203 203 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 IGLC2P0DOY2 106 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 IGLC3P0DOY3 106 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CTRLP40313 264 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 TFF2Q03403 129 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 PDCD1Q15116 288 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RPEL1Q2QD12 228 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 HLA-DRB5Q30154 266 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZN92 141 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 OR5T1Q8NG75 326 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CORO2AQ92828 525 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CXorf1O96002 111 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 PPBPP02775 128 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CD1BP29016 333 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 KRTDAPP60985 99 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RAC1P63000 192 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 HTD2P86397 168 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 PSG4Q00888 419 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 TGFBR3Q03167 851 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CATR1Q13166 79 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 ZIC4Q8N9L1 334 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 KCNS1Q96KK3 526 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 UHRF2Q96PU4 802 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 FOXB1Q99853 325 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 KCNS2Q9ULS6 477 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 COX11Q9Y6N1 276 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 F5P12259 2224 aa9.16□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 TMEM265A0A087WTH1 108 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 LRRC30A6NM36 301 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 SIRPB1O00241 398 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 NPPCP23582 126 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CD38P28907 300 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 LGALS4P56470 323 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RAC3P60763 192 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 PRSS8Q16651 343 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RAET1LQ5VY80 246 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 PET117Q6UWS5 81 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 FGFRL1Q8N441 504 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 WDR31Q8NA23 367 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RDH5Q92781 318 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 GPHA2Q96T91 129 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.15□□□□□ -0.94
LMO3-215ENST00000537304 CDH23Q9H251 3354 aa9.15□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 OR5B21A6NL26 309 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 RAB29O14966 203 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 HYPMO75409 117 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 DKK1O94907 266 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 C1QTNF9P0C862 333 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 IGFBP4P22692 258 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 CDKN1AP38936 164 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 PMP22Q01453 160 aa9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
LMO3-215ENST00000537304 SSPNQ14714 243 aa9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms