RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV1-47P01700 117 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV1-69P01742 117 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00205P59089 165 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RND3P61587 244 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHODHQ02127 395 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CATR1Q13166 79 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TATDN3Q17R31 274 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCTD9Q7L273 389 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYG2Q86SG7 212 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOB3BQ86TA1 216 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPEQ96AT9 228 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C5orf30Q96GV9 206 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.91□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GVG6 124 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LY6LH3BQJ8 138 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PROP1O75360 226 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AVPP01185 164 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERPINE2P07093 398 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5AC1P0C628 307 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CT45A6P0DMU7 189 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CT45A5P0DMU8 189 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CT45A7P0DMV0 189 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F2RP25116 425 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THBS3P49746 956 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHRS2Q13268 280 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSX2Q16385 188 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MIDNQ504T8 468 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COQ8AQ8NI60 647 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C18orf12Q96KH6 178 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51J1Q9H342 316 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR13Q9NZ81 148 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.9□□□□□ -1.3
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKAP6Q13023 2319 aa6.9□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0B4J293 547 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00473A8K010 186 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VGLL3A8MV65 326 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H0Y980 276 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H7C2Y5 167 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXNL1O43396 289 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD5LO43866 347 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FCGR3BO75015 233 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B3GALNT1O75752 331 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 APOA2P02652 100 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SAA4P35542 130 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIR2DS2P43631 304 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LPAR6P43657 344 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF137PP52743 207 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTL8BQ17RB0 113 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LIN54Q6MZP7 749 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF695Q8IW36 515 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LGI3Q8N145 548 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF383Q8NA42 475 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NANPQ8TBE9 248 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MALSU1Q96EH3 234 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GALNT14Q96FL9 552 aa6.89□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TP53RKQ96S44 253 aa6.89□□□□□ -1.31
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