RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	PARVA	Q9NVD7	372 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	POMP	Q9Y244	141 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNG2	Q9Y698	323 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		2.73	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM72	A0PK05	275 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702		M0QYV0	167 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	LGALS9	O00182	355 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	RGS5	O15539	181 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ANGPTL7	O43827	346 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IGLV1-47	P01700	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	HBZ	P02008	142 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	APCS	P02743	223 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SOD3	P08294	240 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IL3	P08700	152 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	PSG2	P11465	335 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCL3	P19876	107 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CCR7	P32248	378 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPA13	P48723	471 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	MARCKSL1	P49006	195 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	GNG10	P50151	68 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	LHX2	P50458	406 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	MP68	P56378	58 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB2A	P61019	212 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF774	Q6NX45	483 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	NAA40	Q86UY6	237 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5W2	Q8NH69	310 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10D3	Q8NH80	312 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM210B	Q96KR6	192 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	EBPL	Q9BY08	206 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	OPN4	Q9UHM6	478 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF222	Q9UK12	451 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	DKKL1	Q9UK85	242 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		2.72	□□□□□ -1.97
FAM49B-222	ENST00000522702	MYH10	P35580	1976 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0U1RQV1	116 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GVX0	72 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	ARL5C	A6NH57	179 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702		C9JQL5	133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702		E5RI56	91 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702		H0YJW9	148 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	PLIN3	O60664	434 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SCO1	O75880	301 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	LY6G6D	O95868	133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCL2	P19875	107 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	ELK4	P28324	431 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	CD52	P31358	61 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SDC4	P31431	198 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	REG1B	P48304	166 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SULT1A1	P50225	295 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	HPCA	P84074	193 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SKP2	Q13309	424 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	ELOC	Q15369	112 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SNCB	Q16143	134 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	GUK1	Q16774	197 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	HACD4	Q5VWC8	232 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10K2	Q6IF99	312 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	NIT1	Q86X76	327 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A45	Q8N413	288 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	TAMM41	Q96BW9	452 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	MCEE	Q96PE7	176 aa		2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
FAM49B-222	ENST00000522702	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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