RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.91□□□□□ -0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 UFD1Q92890 307 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.9□□□□□ -0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 ZMAT4Q9H898 229 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.9□□□□□ -0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 AK3Q9UIJ7 227 aa14.9□□□□□ -0.02
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SH3BP2-220ENST00000511663 SOX15O60248 233 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 IGHV3-11P01762 117 aa14.89□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 LFNGQ8NES3 379 aa14.89□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 KCNK15Q9H427 330 aa14.89□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 HSF4Q9ULV5 492 aa14.89□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 SBSPONQ8IVN8 264 aa14.88□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 ARPC1AQ92747 370 aa14.88□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM203Q969S6 136 aa14.88□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.88□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 CNIH1O95406 144 aa14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 HSMCR30P0CW71 290 aa14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PTX4Q96A99 478 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RCHY1Q96PM5 261 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 FXYD3Q14802 87 aa14.86□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.86□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 RHOVQ96L33 236 aa14.86□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0G2JLM5 398 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ERICH4A6NGS2 130 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 TRDCB7Z8K6 153 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ZP3P21754 424 aa14.85□□□□□ -0.03
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SH3BP2-220ENST00000511663 SERPINB10P48595 397 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMD7P51665 324 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 CBX3Q13185 183 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.037e-7■■■□□ 17
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 PECRQ9BY49 303 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 RDH8Q9NYR8 311 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 STUB1Q9UNE7 303 aa14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SORL1Q92673 2214 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 M0R1X1 148 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A17O43808 307 aa14.84□□□□□ -0.03
SH3BP2-220ENST00000511663 LGALS7P47929 136 aa14.84□□□□□ -0.03
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