RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	BET1	O15155	118 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	XRCC3	O43542	346 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	LSAMP	Q13449	338 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	EBI3	Q14213	229 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	IGSF11	Q5DX21	431 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	GINS4	Q9BRT9	223 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	SCOC	Q9UIL1	159 aa		13.14	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	FGF16	O43320	207 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	SSX5	O60225	188 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	MOS	P00540	346 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	PF4V1	P10720	104 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	OR3A3	P47888	321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	NABP2	Q9BQ15	211 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.13	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	RYR3	Q15413	4870 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	APOA1	P02647	267 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	CTXN2	P0C2S0	81 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	TMBIM6	P55061	237 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	HNF4G	Q14541	408 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	MZT2A	Q6P582	158 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148		Q8N6K4	173 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	PF4	P02776	101 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	SOX6	P35712	828 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	CBX5	P45973	191 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	GPR12	P47775	334 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	TAS2R20	P59543	309 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	OR2D2	Q9H210	308 aa		13.11	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	OR5H14	A6NHG9	310 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	HPGDS	O60760	199 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	ARPC4	P59998	168 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	SPCS2	Q15005	226 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.09	□□□□□ -0.31
MIB2-223	ENST00000508148	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	PTHLH	P12272	177 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	MC5R	P33032	325 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	OR8U1	Q8NH10	309 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		13.08	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148		H0YJW9	148 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148		M0R1X1	148 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	CT45A6	P0DMU7	189 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	CT45A5	P0DMU8	189 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	CT45A7	P0DMV0	189 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	ELK1	P19419	428 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	ACTB	P60709	375 aa		13.07	□□□□□ -0.32
MIB2-223	ENST00000508148	MMD	Q15546	238 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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