RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CKAP5Q14008 2032 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SBF2Q86WG5 1849 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 J3QLW9 94 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RHODO00212 210 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 B3GALT4O96024 378 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CA2P00918 260 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TNFP01375 233 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 BCL2P10415 239 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 COL9A1P20849 921 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TTC32Q5I0X7 151 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR1L3Q8NH93 324 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SOCS4Q8WXH5 440 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 GFI1Q99684 422 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CD207Q9UJ71 328 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 POLR1DQ9Y2S0 133 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.27□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 DKK1O94907 266 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 IFITM1P13164 125 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 DLX6P56179 175 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 C3AR1Q16581 482 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 Q499Y3 187 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 IRF7Q92985 503 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM101Q96IK0 257 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 VGLL1Q99990 258 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 DHDHQ9UQ10 334 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TMED7Q9Y3B3 224 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NCKAP5O14513 1909 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CDC42EP2O14613 210 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 HLA-DQA2P01906 255 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FSTP19883 344 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LIM2P55344 173 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM99Q8N816 258 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NSG2Q9Y328 171 aa5.26□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 KBTBD11O94819 623 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CSN3P07498 182 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00694P0DN24 101 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FCGR2AP12318 317 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ORM2P19652 201 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CA7P43166 264 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 REG1BP48304 166 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FMODQ06828 376 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CXCL9Q07325 125 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF415Q09FC8 603 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SPEM2Q0P670 501 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 TAF10Q12962 218 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CDK5R1Q15078 307 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SGMS2Q8NHU3 365 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PIGCQ92535 297 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 NKD1Q969G9 470 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 C20orf78Q9BR46 151 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 GNG13Q9P2W3 67 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1W2PP11 408 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 A0A1W2PPI3 338 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 OR4C46A6NHA9 309 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 KLK10O43240 276 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ACTL6BO94805 426 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 APOA2P02652 100 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ACVRL1P37023 503 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.25□□□□□ -1.57
PDE4D-216ENST00000507116 RASL11AQ6T310 242 aa5.25□□□□□ -1.57
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