RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493441.5

SMYD3-217, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene SMYD3, Length 823 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM215Q68D42 235 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF544Q6NX49 715 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 CALHM1Q8IU99 346 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 OR1L1Q8NH94 360 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 OR51B6Q9H340 312 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 RWDD2AQ9UIY3 292 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 ALG5Q9Y673 324 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 NUMA1Q14980 2115 aa5.09□□□□□ -1.59
SMYD3-217ENST00000493441 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 IGLV3-25P01717 112 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PRPS1L1P21108 318 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PYCR1P32322 319 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 KIR3DL2P43630 455 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SERPINB9P50453 376 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 CD177Q8N6Q3 437 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 DCAF4L2Q8NA75 395 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 RNF157Q96PX1 679 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 CHST5Q9GZS9 411 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 FBXL15Q9H469 300 aa5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 TRPM6Q9BX84 2022 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 A0A0U1RQV1 116 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 C10orf142B7Z368 130 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SOCS1O15524 211 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 KALRNO60229 2985 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PRNTQ86SH4 94 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 GALNT10Q86SR1 603 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SLC25A45Q8N413 288 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 LINC01006Q8NI28 216 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 RDH5Q92781 318 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 NRTNQ99748 197 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 TSGA10Q9BZW7 698 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 NOX3Q9HBY0 568 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PARP11Q9NR21 331 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 OPN4Q9UHM6 478 aa5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 LRP4O75096 1905 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 H3BP45 60 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 GYG2O15488 501 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 KRT75O95678 551 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 IGHV1-8P0DP01 117 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PMELP40967 661 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 OR2F1Q13607 317 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 IHHQ14623 411 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 CST6Q15828 149 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 MPV17L2Q567V2 206 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 GLYATQ6IB77 296 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 TAC4Q86UU9 113 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 C15orf56Q8N910 161 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 WFDC5Q8TCV5 224 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 DTD1Q8TEA8 209 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 ORAOV1Q8WV07 137 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 EBPLQ9BY08 206 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 OR52D1Q9H346 318 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.06□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PCNX1Q96RV3 2341 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 MFNGO00587 321 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 YIF1AO95070 293 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 IGHV3-11P01762 117 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 CFL1P23528 166 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PRTN3P24158 256 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 AGTR1P30556 359 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 OR4D2P58180 307 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 RPS24P62847 133 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 PPP1R1AQ13522 171 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 C9orf64Q5T6V5 341 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 DEFB106AQ8N104 65 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 TMEM35BQ8NCS4 154 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 FAM210BQ96KR6 192 aa5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMYD3-217ENST00000493441 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.9 ms