RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PEG3Q9GZU2 1588 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 PBRM1Q86U86 1689 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 FANCAO15360 1455 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 GRIN2AQ12879 1464 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 SHANK2Q9UPX8 1470 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5G1P05496 136 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 CRYGDP07320 174 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 FGF12P61328 243 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ARL5BQ96KC2 179 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 CRB1P82279 1406 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 NUP160Q12769 1436 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 CD7P09564 240 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TMBIM1Q969X1 311 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 WDR97A6NE52 1622 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 LRP6O75581 1613 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 SOGA1O94964 1423 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 CD109Q6YHK3 1445 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRJQ12913 1337 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC2Q92887 1545 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 DEXIO95424 95 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf88P0DMB2 117 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 COX5BP10606 129 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00313P59037 77 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 HPCAP84074 193 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TBX5Q99593 518 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 MND1Q9BWT6 205 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 SMDT1Q9H4I9 107 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM2Q13029 1718 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A4O15374 487 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 IL6P05231 212 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM156Q8N614 296 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 Q8WTZ3 238 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC19Q9H756 370 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 HHLA2Q9UM44 414 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 WDR7Q9Y4E6 1490 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 COL18A1P39060 1754 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 LCTP09848 1927 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 NWD1Q149M9 1564 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-212ENST00000491302 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS12A0PJE2 317 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 PFDN6O15212 129 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 HERVK_113P63121 156 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CST9Q5W186 159 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OR10A6Q8NH74 314 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 UPK3BQ9BT76 320 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 DERL2Q9GZP9 239 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf98A8MV24 154 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MRASO14807 208 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A16P16260 332 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL3P19876 107 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CA7P43166 264 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 LPAR6P43657 344 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 PSG4Q00888 419 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 FABP5Q01469 135 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 HTR4Q13639 388 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CAPZA3Q96KX2 299 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 MGLLQ99685 303 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 EMC3Q9P0I2 261 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC11Q96J66 1382 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf49A4QMS7 147 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 KRT7P08729 469 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL2P19875 107 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-212ENST00000491302 OR10J1P30954 320 aa3.63□□□□□ -1.83
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