RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484908.1

ATP6AP1-208, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HSPA12A	O43301	675 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TPBG	Q13641	420 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	P2RY14	Q15391	338 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRAM1	Q15629	374 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TMEM203	Q969S6	136 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PTX4	Q96A99	478 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GFI1	Q99684	422 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908		Q9N2K0	584 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SAP30	O75446	220 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TMEM50B	P56557	158 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ASCL2	Q99929	193 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SCT	P09683	121 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RANBP1	P43487	201 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	VEGFC	P49767	419 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLURP1	P55000	103 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PSG5	Q15238	335 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RAB11B	Q15907	218 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF221	Q9UK13	617 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908		A0A087WW49	117 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PROP1	O75360	226 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SPDEF	O95238	335 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CPE	P16870	476 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CD40LG	P29965	261 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	LFNG	Q8NES3	379 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CLCC1	Q96S66	551 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PECR	Q9BY49	303 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RGS10	O43665	173 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CA2	P00918	260 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TFAP2A	P05549	437 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PDPN	Q86YL7	162 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ZNF383	Q8NA42	475 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	APOA2	P02652	100 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PSMD7	P51665	324 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	AQP4	P55087	323 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	CLDN12	P56749	244 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	TPPP2	P59282	170 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RHOV	Q96L33	236 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	MS4A10	Q96PG2	267 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908		V9GY05	133 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SPN	P16150	400 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	SERPINB10	P48595	397 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PITPNA	Q00169	270 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ATP6AP1-208	ENST00000484908	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		13.82	□□□□□ -0.2

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