RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 PPIAL4GP0DN37 164 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 EFNB1P98172 346 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 IL24Q13007 206 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 DCAF12L2Q5VW00 463 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 LINC01560Q8TB33 94 aa11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
NISCH-207ENST00000479054 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.72□□□□□ -0.53
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NISCH-207ENST00000479054 DTD1Q8TEA8 209 aa11.71□□□□□ -0.53
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NISCH-207ENST00000479054 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa11.71□□□□□ -0.53
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NISCH-207ENST00000479054 ERVS71-1P61550 626 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 FAM3AP98173 230 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 NHLH2Q02577 135 aa11.71□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 PARP11Q9NR21 331 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.71□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PS18 150 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 CXorf65A6NEN9 183 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 HPRT1P00492 218 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 UMODP07911 640 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 REC114Q7Z4M0 266 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 GAPTQ8N292 157 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 AQP3Q92482 292 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ZNF716A6NP11 495 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 SYNGR2O43760 224 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-13P01766 116 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 IGHV3-7P01780 117 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ZIC3O60481 467 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa11.7□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 SNCGO76070 127 aa11.7□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 CYB5R2Q6BCY4 276 aa11.7□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.7□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 FADS6Q8N9I5 356 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 FAM168AQ92567 244 aa11.69□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.69□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 B4DEV8 164 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 SIAH2O43255 324 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 PERPQ96FX8 193 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 H3BQ15 152 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 NPIPB7O75200 414 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 TBR1Q16650 682 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 OR9G1Q8NH87 305 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ZNF488Q96MN9 340 aa11.69□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 MESP1Q9BRJ9 268 aa11.69□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 J3QRE1 110 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ZNHIT1O43257 154 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 LOXL3P58215 753 aa11.68□□□□□ -0.54
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NISCH-207ENST00000479054 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 LRP11Q86VZ4 500 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 GGACTQ9BVM4 153 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GU03 582 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 RNF224P0DH78 156 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 TAS2R60P59551 318 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 GAS1P54826 345 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.68□□□□□ -0.54
NISCH-207ENST00000479054 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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