RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 P2RY14Q15391 338 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 HAGHQ16775 308 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF383Q8NA42 475 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ISOC1Q96CN7 298 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 AGMATQ9BSE5 352 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 AK3Q9UIJ7 227 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 STUB1Q9UNE7 303 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 RAB29O14966 203 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SOCS1O15524 211 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 HSPA12AO43301 675 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 NAPSAO96009 420 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SCTP09683 121 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CD3GP09693 182 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CEACAM6P40199 344 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 FXYD3Q14802 87 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 AHSA2Q719I0 299 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TMED9Q9BVK6 235 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 IRGMA1A4Y4 181 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 OR5H14A6NHG9 310 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CPEP16870 476 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 QRFPP83859 136 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 DYRK1AQ13627 763 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ZNF554Q86TJ5 538 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 CDH26Q8IXH8 852 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 M0R1X1 148 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 EDN2P20800 178 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 HLA-DRB3P79483 266 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PLA2G7Q13093 441 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 POC5Q8NA72 575 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 C5orf30Q96GV9 206 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 GFI1Q99684 422 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.53□□□□□ -1.04
ACTB-209ENST00000473257 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MYL12BO14950 172 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CNIH1O95406 144 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 IGLV2-23P01705 113 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PRH1P02810 166 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TFAP2AP05549 437 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CSN3P07498 182 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MC5RP33032 325 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 WNT4P56705 351 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CLDN12P56749 244 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TAS2R43P59537 309 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 MED21Q13503 144 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SPATA25Q9BR10 227 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TM2D1Q9BX74 207 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TUBA4BQ9H853 241 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 LRRC42Q9Y546 428 aa8.52□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A1O15245 554 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 RBBP9O75884 186 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 UBBP0CG47 229 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ZP3P21754 424 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 CD40LGP29965 261 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 VEGFCP49767 419 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TMEM50BP56557 158 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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